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乙型肝炎病毒基因型研究新进展及其临床意义

来源:国际肝病网 作者:游晶 时间:2010-03-26 点击:

3  HBV基因型和血清型的关系及流行病学分布

根据HBV包膜蛋白上的一个共同抗原决定簇“a”和两个亚型决定簇“d/y”和“w/r”, 将HBV血清型分为4个亚型:ayw, adw, ayr, adr, 又将w分为w1-4,q分为q和q-,使其扩展为ayw1,ayw2,ayw3,ayw4,ayr,adw2,adw4,adrq、adrq-和adw4q-共10个血清亚型。而基因型目前已知的有A-H 8种,但由于血清亚型是外膜蛋白的表现型,是由病毒外膜蛋白上的一些氨基酸残基决定的,从基因密码到蛋白质要经过转录和翻译,再经过修饰加工形成功能蛋白质,因而蛋白质的种类和数目多于基因的种类和数目,并不能真正反映病毒基因组的差异,基因型能更好地反映HBV核苷酸的自然异质性。

研究发现不同血清亚型可属于同一基因型,而同一血清亚型可分布于不同基因型,但HBV血清亚型和基因型之间有一定的相关性,它们的关系为:A型(adw2、ayw1),B型(adw2、ayw1),C型(ayr、adrq、adrq-、adw2),D型(ayw2、ayw3),E型(ayw4),F型(ayw4、adw2、adw4q-),G型(adw2),H型(adw3); 即adr和ayr亚型与C基因型相关,ayw2和ayw3与D基因型相关,ayw4与E基因型相关,adw4和F基因型相关,然而血清亚型与基因型间的相关性并非绝对相对应,在A、B、C基因型中均可出现adw2。

近年来HBV基因型分布的研究渐成为国内外学者关注的研究热点。研究发现,HBV基因型的分布具有一定的区域性,A型主要分布于西欧、北欧、北美洲及非洲地区;B型和C型是亚洲和大洋洲的特征性基因型,B型主要见于中国、日本、印度尼西亚、越南和巴西,其中Bj基因型在日本被发现,而Ba基因型则分布在整个亚洲;C型主要见于中国、韩国、日本、越南和玻利尼西亚; D型分布最为广泛,主要分布于中东、北非和南欧,亦是地中海地区HBV的主要基因型,还发现于亚洲少数地区;E型主要分布于非洲撒哈拉沙漠地带;F型主要分布于美国、南美洲的土著居民;G型在法国、美国、德国、英国和意大利被发现;H型已在尼加拉瓜、墨西哥及美国加利弗尼亚地区被发现。

大量研究表明,我国HBV基因型南方以B型为主,北方以C型为主,D型仅见于西部及少数民族地区,A、F型偶有发现,还未发现其他型别。也有学者研究发现D基因型在我国宁夏地区、广东地区和香港地区约占感染者的15%,因而HBV基因型在我国的确切分布状况仍不十分清楚。

4  HBV基因型的分型方法

1988年Okamoto首先提出了乙型肝炎病毒基因分型法。随着分子生物学技术的发展,基因分型的方法也在不断进步,渐趋简化、准确。HBV基因分型方法主要有(1)HBV全基因测序;(2)S基因序列测定; (3)S基因聚合酶链反应-限制性片断长度多态性分析(PCR-RFLP);(4)HBV基因型特异性表位单克隆抗体的ELISA;(5)HBV基因型特异性线型探针检测法;(6)HBV基因型特异性引物PCR(PCR-SSP);(7)PCR微板核酸分子杂交-ELISA法;(8)基因芯片技术:基因芯片(gene chip),又称基因微矩阵 (microarray),其原理是将大量特定的基因片段或寡核苷片段作为探针有序地和高密度地排列固定于玻璃或硅等载体上,然后与待测的有荧光标记的样品核酸按碱基配对的原则进行杂交,通过激光共聚焦系统检测杂交信号强度,经计算机分析处理数据资料,获取样品分子的数量和序列信息,从而可对核酸序列进行大规模、高通量的研究。基因芯片技术是近几年发展起来的新技术,它通过借鉴电子计算机芯片阵列寻址原理,利用核酸分子杂交和化学发光技术,使检测结果具有灵敏度高、所需样本微量和操作简便等特点。